Петър Баберков е роден в Русе. Първоначално изучава цигулка и композиция в София. По-късно заминава за Прага, където учи при проф. Вацлав Добиаш, а от 1956 г. – във Виена при проф. Карл Шифке. Там той учи и дирижиране при проф. Ханс Сваровски. След дипломирането си Петър Баберков свири като цигулар и виолист в различни симфонични оркестри. Музикантът гастролира с много диригенти и солисти в известните концертни зали на Берлин, Лондон, Париж, Рим, Амстердам и Ню Йорк. Работил е с личности като Рафаел Кубелик, Антал Дорати, Карл Бьом, Йозеф Крипс, Святослав Рихтер, Мстислав Ростропович, Йехуди Менухин и Давид Ойстрах. Баберков е основател и диригент на Рейнския камерен оркестър, Рейнския ансамбъл солисти, Новия стокхолмски камерен оркестър и в продължение на 30 години ръководи Studio – Orchester Duisburg. Съществен принос е и неговата педагогическа работа с млади инструменталисти. Той е създал музиканти, които днес свирят в много оркестри. От 1987 г. до 1997 г. Петър Баберков е професор по дирижиране във Фрайбург и работи със симфоничния оркестър на Висшето училище там. Той е канен като гост диригент. Като композитор пише творби в областта на камерната, симфоничната и оперната музика.

Опера:
„Рибата”;
„Сивият град”;
„Малкият принц”.

Балет:
„Възкресение” – балет по Лев Толстой

Произведения за симфоничен оркестър:
Симфонична поема;
Концерт за пиано и оркестър;
Симфония концертанте за пиано и оркестър;
Концерт за виола и оркестър;
Пет симфонични песни.

Произведения за струнен оркестър:
Концерт за цигулка, шест духови и струнни;
Шест фрагменти за струнен оркестър;
Четири движения за струнни.

Камерна музика
Ансамблова:

Духов квинтет: Соната за флейта, цигулка, виолончело, челеста, арфа и ударни; “Movimenti per tre”

За флейта, виолончело и арфа.

Соло инструменти:
Соната за китара; други сонати

Вокална:
Песни за сопран и пиано: „Инкарнация” за сопран

Хорова музика:
Магнификат за солисти и оркестър; Псалм 142 за хор.